Dalam Proyek Pengetahuan Hijau, BaKTI berperan sebagai pengelola pengetahuan  dari kegiatan-kegiatan Proyek Pengetahuan Hijau dan penerima hibah Proyek Kemakmuran Hijau. Wilayah kerja BaKTI meliputi Provinsi Sulawesi Barat: Kab. Mamuju dan Mamasa; Provinsi NTB: Kab. Lombok Tengah, Lombok Timur, dan Lombok Utara; Provinsi NTT: Kab. Sumba Timur, Sumba Tengah, Sumba Barat Daya, Sumba Barat; Provinsi Jambi: Kab. Merangin, Muaro Jambi, Kerinci, Tanjung Jabung Timur.

Sebagai pengelola pengetahuan dalam Proyek Pengetahuan Hijau, saat ini Yayasan BaKTI sedang membuka peluang kerja untuk posisi Admin Officer .